Nesta situação ele nao havera problemas em nao escriturar esta GNRE? 

Felipe Civa, boa tarde.

Não haverá problemas em não escriturar na EFD, pq inexiste o referido código de receita na tabela de código de apuração da EFD.

O que poderá ocorrer é mediante a auditoria da Sefaz, expedir notificação de autorregularização para apuração do imposto, com código de receita válido na EFD, conforme orientado anteriormente, quando o contribuinte, tem a inscrição no estado de Mato Grosso e encontra-se na obrigatoriedade de entrega da EFD, e se for o caso, deverá proceder com a alteração do código de receita no documento pago.