Boa tarde, 
Como proceder quando o CT-e foi emitido com o tomador incorreto? OBS: já foi efetuado o transporte da mercadoria.
Está fora do prazo de cancelamento de MDF-e vinculada ao CT-e, não sendo possível efetuar seu cancelamento. 

Outra pergunta, é emitido CT-e dentro no mesmo município quando o transporte está ligado a várias documentos fiscais (várias vendas)? 
Se fosse somente uma NF-e, caberia somente o MDF-e?