Bom dia

1 - Qual CFOP e CST correto a ser usado na nf de compra desse veículo?

Se a operação é interna, faça uma nota de entrada com base no art. 201.

cfop 1.102 - Compra para comercialização.
Classificam-se neste código as compras de mercadorias para serem comercializadas.

CST

Pois nas aquisições de mercadorias de um não contribuinte do ICMS, não esta sujeito a incidência do ICMS 

2 – O correto é que nós (empresa) emitamos a nota de compra desse veículo, visto que quem irá vender o veiculo para nós é PF sem inscrição estadual, certo?

Sim esta correto com base no art. 201 do RICMS - MT

3 - Essa operação de entrada, tem ICMS? a ser destacado em nota fiscal de compra? qual embasamento legal?

Não com base nos art. 2 a 4 do RICMS_MT