Bom dia,

A substituição é sobre a mercadoria, de forma que é o valor da mercadoria mais o MVA da mercadoria X alíquota interna da mercadoria menos ICMS próprio do remetente igual ao valor do ICMS ST a recolher.

Com base no art. 8º do anexo X empresas do simples nacional no momento do cálculo do ICMS ST pelo seu cliente pode usar para abatimento do ICMS próprio a alíquota interna da mercadoria, tendo em vista que é uma operação interna.

Outro forma e nas operações internas multiplicar a alíquota interna apenas sobre o valor da MVA, que dará o mesmo valor a recolher do ICMS.

Abaixo esta o Link do portal do conhecimento sobre ST.

Link: https://www.portaldoconhecimento.mt.gov.br/sobre-a-st