Se produtos forem adquiridos no estabelecimento de MT por consumidores, ainda que localizados em outras Unidades da Federação, e entregues diretamente ao comprador mediante "venda no balcão" (presencialmente), não haverá a operação interestadual, pois o consumo ocorre neste Estado, sendo, portanto, considerada "operação interna".

Por outro lado, na hipótese da tradição efetiva da mercadoria ocorrer no território do Estado de domicílio do adquirente, a operação será considerada interestadual, e será devido o diferencial de alíquotas,

 Sobre o assunto tem a resposta de consulta tributária junto a SEFAZ/MT constante na INFORMAÇÃO Nº 045/2018 – GILT/SUNOR.

INFORMAÇÃO Nº 045/2018 – GILT/SUNOR. - Resposta de consulta muito boa 

Só um ultimo esclarecimento...

Assim, se os produtos forem adquiridos no estabelecimento da consulente por consumidores finais não contribuintes do ICMS, ainda que localizados em outras Unidades da Federação, e entregues diretamente ao comprador mediante "venda no balcão" (presencialmente), não haverá a operação interestadual, pois o consumo ocorre neste Estado, sendo, portanto, considerada "operação interna".

Mas se a venda aconteceu presencial " Venda no Balcão" porém não foi instalado nenhuma peça dentro do MT e sim levado os itens para o outro estado, só que a entrega não foi feita pela empresa que vendeu e sim pelo comprador ai caracteriza uma venda interestadual pois a mercadoria foi levada e instalada em outra UF.

Vou ter que perguntar para o cliente se o mesmo vai fazer esse procedimento para então realizar a emissão da NFe  

Neste caso trata de venda interestadual, consequentemente CFOP de venda para outra UF.