@manoell, boa tarde!

Operação interestadual  - documento fiscal emitido com CFOP 6101 

1 - Deve-se fazer o recolhimento antecipado do ICMS ST?

Na hipótese de as mercadorias se enquadrarem nas descrições dos itens 94.0 e 94.1 da TABELA XVII, PR​ODUTOS ALIMENTÍCIOS, do Anexo X do RICMS-MT, sim, deverá apurar e recolher o ICMS ST na condição responsável solidário (§ 2°, Art. 4° do Anexo X do RICMS-MT).

2 - Na NF-e o imposto tem que ser destacado em campo próprio?

Sim.  Incumbe ao remetente da mercadoria destacar o imposto (inciso I, Art. 15 do Anexo X do RICMS-MT).

3 - O CFOP da NF-e deve ser o 6.401?

Não. Nas venda de mercadoria sujeitas a apuração do imposto pelo regime de substituição tributária o remetente, na venda de mercadoria adquirida ou recebida de terceiros, utiliza o CFOP 6.403 - Venda de mercadoria adquirida ou recebida de terceiros em operação com mercadoria sujeita ao regime de substituição tributária, na condição de contribuinte substituto. (Anexo ao Convênio SINIEF s/n°, de 15/12/70​)

4 - Há algum benefício/isenção de ICMS destes produtos?

Prejudicada. Sr. Manoell, a norma que concede benefício fiscal interpreta-se literalmente (Art. 111 do CTN), assim, caso queira informação sobre aplicação de benefício fiscal há a necessidade de qualificação do contribuinte interessado, informação da descrição da mercadoria e do código NCM.

5 - Mesmo passando na barreira conferindo e carimbando as NF-e, as compras anteriores que não fizeram recolhimento do ICMS estarão sujeitos ao recolhimento?

Sim. O destinatário das mercadorias ou bens, na qualidade de contribuinte substituído, é solidário em relação ao ICMS devido à título de substituição tributária (§ 2°, Art. 4° do Anexo X do RICMS-MT).

6 - Por qual motivo o ICMS ST não foi cobrado na barreira, seria por conta do CFOP da NF-e estar incorreto caso a resposta da pergunta n° 3 for sim. 

Prejudicada. Não manifesto sobre procedimentos de outra unidade fazendária. Objetivo sempre é de prestar esclarecimento sobre a aplicação da legislação a uma determinada operação.

7 - O fato do próprio contribuinte buscar a mercadoria isso o isenta de tal recolhimento?

Não. O destinatário das mercadorias ou bens, na qualidade de contribuinte substituído, é solidário em relação ao ICMS devido à título de substituição tributária (§ 2°, Art. 4° do Anexo X do RICMS-MT).